L’ASSOMESCA est guidée par une structure de gouvernance à trois niveaux qui garantit la transparence, la redevabilité et l’efficacité opérationnelle. L’Assemblée Générale définit les orientations stratégiques, le Conseil d’Administration assure la supervision et le contrôle, et le Secrétariat Exécutif gère les opérations quotidiennes. Ensemble, ces trois instances veillent à ce que les structures sanitaires membres reçoivent l’appui dont elles ont besoin pour offrir des soins de qualité à leurs communautés.